Desaparecen.
El comando /spawn es un comando del servidor, y sus usos se cobran al servidor.
Como el propio servidor crea monedas cuando se necesitan, simplemente desaparece.
El unico dinero que puede cobrar el ayuntamiento es el del Towny, los impuestos a los residentes. Y de todos modos este dinero va al fondo común de la ciudad y se usa para pagar el propio towny y las zonas protegidas.