Quisiera saber si el treecapitator mod se podría utilizar en el server. Todavía no lo he instalado por si acaso

No sirve.
Ese mod cambia la mecanica del juego, rompes un bloque de madera y automaticamente rompe todo.
Pero en un servidor la mecanica la pone el propio servidor, tu rompes un bloque y el server te dice lo que ocurre. Como el server no tiene el treecapitator mod el arbol seguirá en su sitio salvo el bloque roto.

Instalalo y juega con el en modo singleplayer donde si funciona, pero cuando entres al servidor no funcionará.

A, ok muchas gracias Luriant. Duda resuelta