Buenas , esto no es un bug , la Shop esta ajustada al precio de los materiales, la piedra es más barata que la madera y más fácil de encontrar, por eso vale menos..
por ejemplo si un bloque de madera vale X dinero y se necesitan 2 bloques para una espada será x+X + el precio de un palo en la Shop , corregidme si me equivoco...
saludos